Eliza Patricia Dushku es hija de padre albano y madre danesa, ambos profesores de profesión y creencias mormonas, que se divorciaron antes de nacer su hija, quien no profesa, al contrario que sus progenitores, la religión mormona.

En su niñez aprendió a tocar el piano y acudió a clases de baile. Tiene tres hermanos mayores, llamados Aaron, Ben y Nate.
Este último también se dedica a la actuación.

Inició su trayectoria como actriz en el teatro, representado obras en el Watertown Children's Theatre, en donde tomó clases de interpretación.
En 1992 debutó en el cine con la comedia "Aquella noche" (1992), título dirigido por Craig Bolotin que protagonizaban C. Thomas Howell y Juliette Lewis.